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蘑菇可以分为食用蘑菇，药物蘑菇，毒蘑菇和腐菌四类。毒蘑菇是不可食用的蘑菇，因为其中含有对人体有害的物质。腐菌中只有少数的品种可以食用，比如灵芝等。肉眼分辨有毒腐菌和有毒蘑菇都是通过颜色和菌盖进行判断。
毒蘑菇。毒蘑菇一般情况下都生长在深山中，通常表面都会呈现出鲜艳的颜色，而且毒蘑菇的菌盖上有特殊形状的斑块，还是比较容易辨认的。灰花纹鹅膏，菌盖的中心呈现出黑色的放射状花纹，菌盖的周围呈现出白色的放射纹。裂皮鹅膏全身呈现出鲜艳的米白色或者纯白色，边缘都有辐射状斑纹。呕吐红菇的菌盖中间呈现出红色，边缘的颜色呈现为粉红色。鹿花菌的菌盖呈现为紫色，红色等多种颜色。不要采摘颜色鲜艳的蘑菇。
另外大部分的毒蘑菇的表面都存在黏液，而且菌盖被破坏后，颜色会迅速的发生变化。有毒的蘑菇多数带有刺激性和酸性的味道。主要是硫化物和其它有毒化学物质聚集的结果。有毒的蘑菇保存相对完整，没有被破坏的痕迹。蘑菇的周围会出现雨水打湿后产生混浊物，这些都是毒蘑菇分泌的物质。
腐菌。腐菌中的种类也很多，主要可以分为木腐菌和草腐菌两种。其中包括很多有毒的腐菌。腐菌中也会存在颜色鲜艳的品种，这些都是无法食用的。还有一些腐菌虽然颜色暗淡，但是生长在有毒的腐木中，同样会携带有毒物质，通过判断腐木的状况，比如周围植物的生长情况，腐木的完整性。可食用的腐菌包括名贵中药灵芝，经常食用的银耳，黑木耳和金针菇等。
食用蘑菇和药用蘑菇的种类就比较繁多了，包括香菇，牡蛎蘑菇，冬虫夏草和白桦茸等，所以的蘑菇都需要煮熟后才能食用。
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